s軌道（エスきどう）とは、原子を構成している電子の軌道のひとつ。方位量子数は0であり球状の1つの軌道しか存在しない。
たとえば基底状態（主量子数 n=1）の水素原子、ヘリウム原子の電子配置は1s軌道である。s軌道はSブロック元素の物性に関わっている。
s軌道はp軌道やd軌道と混成軌道を作る。
s軌道同士、s軌道とsp混成軌道、s軌道とp軌道の結合はσ結合を形成する。
